这场战役可以分为三个阶段，第一个阶段，天龙舰发现日本舰队，双方随即展开追逐，日本舰队还派出鱼雷艇，对天龙舰发动攻击，结果被天龙舰击沉两艘。
第二个阶段，华夏帝国舰队在林飞的指挥下，抢占有利阵位，对高千穗舰、浪速舰和秋津洲舰发动打击。
第三个阶段，华夏帝国舰队在击溃高千穗舰等三舰之后，和三景舰展开决战。
在三个阶段的战役中，华夏帝国舰队击沉日舰两艘，高千穗舰、秋津洲舰；重创日舰四艘，浪速舰、松岛舰、严岛舰和桥立舰，并将旗舰松岛舰俘获；击沉六艘鱼雷艇，自身沒有战舰被击沉，共击毙、击伤日本海军1700多人。
澎湖大海战在世界历史上有着极其深远的意义，政治意义方面，这场战役标志着日本自明治维新以來建设的海军力量土崩瓦解，这一战之后，日本发疯一般制造武器装备，走上了军国主义的不归路。
这场战役还标志着华夏帝国海上力量正式进入东亚，由于清国北洋舰队全军覆沒，日本舰队元气大伤，华夏帝国舰队一跃成为东亚海上霸主。
军事意义方面，这次战役是无线电通讯设备第一次应用在海战上，而且无线电通讯设备是华夏帝国海军取胜的关键，可以这样说，沒有无线电通讯设备，这一战的结果就将逆转，不过除了英国，还沒有国家知道林飞拥有无线电通讯设备。
10月5日下午2点，林飞责成帝国宣传部，向马尼拉的欧洲三大通讯社发布通报：10月2日，华夏帝国舰队在澎湖海域重创日本海军南方派遣舰队，击沉其战舰两艘，鱼雷艇六艘，重创其余四艘战舰，其中旗舰松岛舰被我舰队俘获。
虽然这个消息是时隔三天才发出的，可是在这个通讯手段极为落后的年代，这种时间间隔已经算短的了。
林飞还把松岛舰的照片送给了欧洲三大通讯社，照片上，松岛舰上拉起了一条横贯舰身的横幅，横幅上用汉字和日语写着……我是松岛舰，我是支那猪的俘虏。林飞在这里特地用了“支那猪”，就是想要讽刺日本人。
欧洲三大通讯社十分清楚这张照片的价值，他们特地派专人乘船到新加坡，用英国人的照相平板印刷设备把照片印刷在了报纸上，虽然照片印得十分模糊，可是松岛舰和松岛舰上的巨大横幅还是依稀可以辨认。
这个消息一经发出便震撼了世界，相比于其他国家的人震撼于海战的结果，日本人震撼的是，他们的旗舰松岛舰，竟然被林飞俘获了，日本人向來视被俘为奇耻大辱，普通一兵都宁可自杀不愿被俘，现在一艘战舰，还是堂堂大日本帝国联合舰队的旗舰，竟然被低贱劣等的支那猪俘虏了…
日本人都不敢、不愿相信这个消息，可是有照片在，铁证如山，不容他们不相信，日本人觉得耻辱无比，以致于凡是和“松岛”沾边的事情都受到了影响。“松岛”是日本的一大姓氏，不少姓“松岛”的人在这件事情之后改换姓氏；“松岛”还是日本的一处美景，这件事情弄得那处景观人烟稀少，门口罗雀。
在后世日本人的史书中，这件事情也成了“敏感事件”，史学家对松岛舰被俘一事要么避而不谈，要么一笔带过，也有一些史学家干脆直接否定了这件事情的存在，在叙述旗舰被俘事件的时候总要加上“有不可靠传言说”的字样。
日本人感到羞耻无比，华人却感到了扬眉吐气，投奔华夏帝国的人更多了，越南、暹罗、缅甸、爪哇、苏门答腊，华夏帝国一时间成了南洋华人的中心。
10月7日，战役结束后的第五天，上午9点，伊东佑亨把众舰长召集起來，只不过松岛舰舰长有栖川威仁，高千穗舰舰长野村贞，鱼雷艇舰队司令铃木诚，他们永远不能再來了。
会议室里的气氛压抑极了，比第四旅团的运输船被偷袭那次还压抑，所有人都低着头，沒有一个人说话。
伊东佑亨把桌子一拍，朗声说道：“胜败乃兵家常事，这是连支那猪都明白的道理，你们怎么都垂头丧气的？还有帝国武士的样子吗？”
众人的神色这才振奋了些，伊东佑亨接着说道：“好了，不说这些了，大家振作起來，我们还有机会复仇呢…我们來讨论一下，我们败在什么地方，以后如何进行改进，谁先说？”
秋津洲舰的舰长上村彦之丞举起了手，伊东佑亨点点头说道：“上村，你先说吧。”
上村彦之丞说了声“好”，这才说道：“我觉得我们完全败在华夏帝国的神秘武器上。”